La Plataforma Tecnológica del Sector Marítimo Español trata de integrar a todas aquellas entidades cuya actividad se relaciona fundamentalmente con el mar y demás medios acuáticos. Es decir, aquellos agentes que correspondan a alguno de los grupos siguientes:

• Administración y Entidades Públicas.
• Centros expertos en las diferentes áreas de investigación.
• Empresas del sector marítimo.

La organización de la Plataforma tiene tres niveles que reflejan las responsabilidades y las relaciones entre los diversos órganos que la integran.

• En la cúspide de la decisión de la Plataforma se encuentra la Asamblea General, de la que forman parte todas las entidades miembros de la PTM. Dichas entidades estarán representadas por sus niveles más altos de organización. Asimismo, forman parte de la Asamblea General los altos representantes de las Administraciones y de los Centros de investigación involucrados.
• El segundo nivel está constituido por un Comité Gestor, función asumida por la Fundación INNOVAMAR, entidad promotora de la PTM. La Fundación INNOVAMAR asume la dirección de la PTM y de sus tareas y actividades, así como el nombramiento de la Secretaría Técnica y de los demás órganos de funcionamiento, a excepción de la Asamblea General.
• Como elemento de organización y soporte administrativo se establece una Secretaría Técnica de la PTM, quien asume la coordinación administrativa de la plataforma, sin capacidad de decisión sobre las tareas y actividades de ésta.
• Como elementos de apoyo de la Plataforma se establece un tercer nivel formado por los Grupos de trabajo, que está integrado por expertos del sector.